全面基因组分析(CGP)一次读取肿瘤数百个基因,为治疗选择提供依据。本文说明适合人群、报告能说明什么与不能说明什么,以及必须了解的局限性。由曼谷是隆 YOUNIFY Clinic 医疗团队讲解。
内容
要点
- 全面基因组分析(CGP)是一次读取肿瘤数百个基因的检测,目的是为治疗选择提供依据。
- CGP 检测的是肿瘤细胞的基因,而不是用于预测未来患癌风险的胚系(遗传)基因检测,两者目的完全不同。
- 并非所有肿瘤都能检出可用药物针对的基因变异;报告篇幅长,并不代表可选的治疗方向多。
- CGP 不是面向尚未确诊人群的癌症筛查手段,报告未见异常也不能据此认为没有疾病。
- 送检之前应先明确:这份结果会改变哪一步决策。所得信息请带回给正在为您诊治的医生共同讨论。
什么是全面基因组分析(CGP)
“肿瘤基因检测”是患者与家属近年来听得越来越多的说法,但同一个说法其实涵盖了多种目的不同的检测。本文由 YOUNIFY Clinic 医疗团队整理,说明全面基因组分析(CGP)究竟是什么、与以往的基因检测有何不同、哪些人可能适合、报告能真正说明什么,以及同样重要的——不能说明什么。整体思路可参阅什么是精准肿瘤治疗与精准肿瘤诊疗服务。
CGP 是指采用二代测序(NGS)技术,一次性读取肿瘤组织中数百个基因的序列,目的是寻找可能用于指导治疗选择的基因变异。
有一点需要在开头就说清楚:CGP 检测的是肿瘤细胞的基因,而不是检测患者自身的遗传基因以预测将来是否会患癌。两者是不同的检测,目的不同,解读方式也不同。
CGP 通常检测的变异类型包括:
- 点突变与小片段插入缺失 = 遗传密码上的小范围改变,例如 EGFR、BRAF、KRAS 中所见的变异。
- 基因融合 = 两个基因异常连接,例如与 ALK、ROS1、RET、NTRK 相关的融合。
- 拷贝数变异 = 基因拷贝数增加或减少,例如 HER2 或 MET 扩增。
- 免疫相关生物标志物 = MSI(微卫星不稳定性)与 TMB(肿瘤突变负荷),以及通常以另一种方法检测的 PD-L1 蛋白染色。
与单基因检测有何不同
以往的检测多针对某一个基因或少数几个位点,围绕明确的临床问题展开,所需组织较少、出结果较快。CGP 则一次读取数百个基因,信息面更广,但对组织量的要求更高、耗时更长,并且所得信息需要由团队共同解读。
| 项目 | 单基因 / 热点检测 | 全面基因组分析(CGP) |
|---|---|---|
| 检测基因数量 | 仅检测所提问的基因或位点 | 一次检测数百个基因 |
| 适用情形 | 临床问题明确,例如一线治疗决策前检测单一基因 | 需要整体信息,例如定向检测阴性或属于少见瘤种 |
| 所需组织量 | 通常较少 | 通常需要更多组织与更高的肿瘤细胞比例 |
| 出报告时间 | 通常较短 | 通常较长,取决于实验室 |
| 所得信息 | 针对性强,解读相对简单 | 覆盖面更广,但出现意义未明结果的可能性也更高 |
| 是否需要团队解读 | 多数情况较为直接 | 建议提交分子肿瘤讨论会(MTB) |
如何选择并不是哪一种更优的问题,而是当下的临床问题是什么、现有组织有多少、以及在必须作出决定之前还有多少时间。
报告能说明什么、不能说明什么
CGP 报告通常将结果分为若干类,并非每一类都能据以选药。患者与家属了解这一区别很有意义,因为长达数页的报告并不代表可选的治疗方向很多。
一、可用药变异(actionable alteration)。这一类对决策的影响最大,例如在合适的瘤种背景下检出与 EGFR、ALK、ROS1、RET、NTRK、BRAF、HER2 或 MET 相关的变异。不过,检出靶点并不等于相应药物就适合这位患者,还需结合瘤种、分期、既往治疗与身体状况综合判断。各类药物的作用机制见靶向治疗与免疫治疗如何起作用。
二、用于考虑免疫治疗的生物标志物,包括 MSI、TMB 与 PD-L1。这些指标可作为决策参考,但没有任何一项能够完全准确地预测结果:数值看似有利者可能并无反应,反之亦然。
三、临床意义未明的变异(VUS)。这类结果在报告中相当常见,意思是确实检出了基因改变,但现有证据尚不足以说明其含义。不应据此选药,也不应解读为坏消息或好消息。
四、提示可能存在胚系变异的线索。肿瘤检测有时会发现某些迹象,提示该变异也可能存在于正常细胞中。这种情况需要通过专门的胚系血液检测加以确认,并配合遗传咨询,因为它涉及直系亲属。
五、未检出可用药靶点。这是常见且正常的结果。并非所有肿瘤都能检出可用药物针对的基因变异。此时仍有其他标准治疗可供考虑,而且这一信息本身也有价值,可以排除不太可能有效的方向。
把这五类结果与临床背景结合起来解读,属于分子肿瘤讨论会(MTB)的工作,而不是由某一个人逐行判读。
不同瘤种常见的生物标志物
没有任何一项生物标志物与所有瘤种都相关。下列内容用于说明为什么不同患者所做的检测项目不同,仅供健康教育参考,并非送检规范。
- 肺癌 — 常考虑 EGFR、ALK、ROS1、BRAF、RET、MET、NTRK、KRAS,并结合 PD-L1
- 结直肠癌 — 常考虑 KRAS、BRAF、HER2 与 MSI 状态
- 乳腺癌 — 常考虑 HER2 与激素受体,部分情形下会考虑胚系信息
- 消化道肿瘤(胃、食管、胰腺、肝与胆道) — 常考虑 HER2、MSI、TMB 及各器官相关的其他变异
- 前列腺癌 — 常考虑 DNA 修复相关信息,部分情形下考虑 MSI 状态
选择与疾病和当下情况相匹配的检测套餐,属于诊治团队的职责,不建议患者依据网络信息自行决定。
哪些人可能适合
总体而言,CGP 多用于已经确诊肿瘤、且存在“结果有可能改变决策”的临床问题的患者。没有明确问题支撑的检测,通常不会改变治疗方案。
- 已确诊为局部晚期或转移性肿瘤,正在规划下一线治疗
- 在现有治疗中疾病继续进展,希望了解依据基因特征是否还有其他方向
- 已做过定向基因检测但未检出靶点,而临床特征仍提示可能存在
- 少见瘤种,或原发部位不明的肿瘤
- 正在考虑参加以分子标准筛选入组的临床研究
本项检测并非为以下人群设计:尚未确诊肿瘤者。CGP 不是面向健康人群的癌症筛查手段,无法判断您将来是否会患癌,报告未见异常也不能据此认为没有疾病。
需要了解的局限
在决定检测之前,患者、家属与医疗团队应对以下局限达成共识,以免产生与检测能力不符的期待。对于从境外前来就诊的患者还有一点很实际:既往病理蜡块通常需要向原就诊医院调取,这一环节所需时间有时比检测本身更长。
- 并非所有肿瘤都能检出可用药物针对的基因变异。
- 组织标本可能不足或质量不够,需要重新取样,或改为血液检测。
- 存放时间较久的组织可能无法反映疾病当前的状态,因为肿瘤会随时间与既往治疗而发生变化。
- 同一位患者体内不同部位的肿瘤,基因特征可能并不一致(肿瘤异质性),仅取一处可能无法覆盖全部情况。
- 报告中相当一部分结果属于 VUS,目前尚不能据以决定治疗。
- 即使检出了与药物相符的靶点,也无法预先判断某一位患者是否会有反应,结果因人而异。
- 可能出现涉及直系亲属的信息,因此在有指征时应同时提供遗传咨询。
- 本项检测不构成停止或推迟现有治疗的理由。请与正在为您诊治的医生共同决定,不要自行调整或停用原有治疗。
若组织不足或存放时间过久,血液检测可作为可考虑的方案,详见液体活检与 ctDNA。
费用取决于所选择的检测项目与治疗方案。医疗团队会在开始之前评估并完整告知全部费用。
在 YOUNIFY 的就诊流程
在 YOUNIFY Clinic,送检 CGP 之前一定先把临床问题问清楚:这份结果会改变哪一步决策?如果答案是不会改变,医疗团队会如实说明,而不是安排检测。
- 1. 面诊并回顾既有资料 — 病理报告、特殊染色、影像资料与既往治疗经过,包括境外医院出具的报告。
- 2. 核查现有标本 — 评估既往蜡块的组织量与肿瘤细胞比例是否足够。
- 3. 确定取材方式 — 使用既往组织、重新取材,或以血液检测替代或补充。
- 4. 签署知情同意前充分说明 — 检测能回答什么、不能回答什么、未检出靶点的可能性,以及出现涉及家属信息时的处理方式。
- 5. 提交分子肿瘤讨论会(MTB) — 结合临床资料共同解读报告。
- 6. 与患者及家属共同回顾结果 — 用可以理解的语言逐段说明,并交代可选方向与目前仍不清楚的部分。
如果治疗方案涉及化疗、放疗、肿瘤手术或需要静脉给药的治疗,医疗团队会协调转诊至合作医疗机构。
如果您正在考虑是否需要做肿瘤基因检测,并想了解结果会如何影响治疗决策,可参阅YOUNIFY 精准肿瘤诊疗服务,或通过 WhatsApp(+66 81 556 9696)与微信联系医疗团队。所得信息请带回给正在为您诊治的医生共同讨论,在其另有建议之前请继续原有治疗。
常见问题
肿瘤基因检测与遗传性肿瘤风险检测有什么区别?
CGP 检测肿瘤组织的基因,用于指导治疗选择;风险检测属于胚系(遗传)基因检测。两者是不同的检测,目的不同,胚系检测还需配合遗传咨询。
做了检测就一定能用上靶向药吗?
不一定。并非所有肿瘤都能检出可用药物针对的基因变异;即使检出靶点,也仍需结合瘤种、分期、既往治疗与身体状况综合判断。
是否必须重新穿刺取组织?
取决于既往组织的数量与质量是否足够,以及存放时间的长短。部分患者可直接使用既往组织,部分需要重新取材,也有部分可以用血液检测替代或补充。
报告里出现 VUS 是什么意思?
VUS 指确实检出了基因改变,但目前证据尚不足以说明其临床意义。不应据此选药,也不应解读为坏消息或好消息。医疗团队会说明下一步应如何处理。
出报告要等多久?
所需时间取决于检测种类与实验室。医疗团队会在送检前告知预计时间范围,并一并判断是可以等待结果,还是应先按标准治疗开始。
尚未确诊肿瘤的人可以做 CGP 来筛查吗?
不可以。CGP 的设计用途是读取已确诊肿瘤的基因,并不是面向健康人群的癌症筛查手段,其结果也无法判断您将来是否会患癌。
参考文献
- National Cancer Institute — Biomarker Testing for Cancer Treatment
- Mosele F, et al. Recommendations for the use of next-generation sequencing (NGS) for patients with metastatic cancers: ESMO Precision Medicine Working Group. Ann Oncol. 2020
- Li MM, et al. Standards and Guidelines for the Interpretation and Reporting of Sequence Variants in Cancer (AMP/ASCO/CAP). J Mol Diagn. 2017
- NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology
医疗记录
本文仅供一般参考,不能取代医学检查、诊断或治疗。如果症状严重、变化很快或属于紧急情况,请及时就医。
结果因人而异,接受治疗前请咨询医生。
